Atomic structure and plasticity of the MthK-CTX complex investigated by cryo-EM, NMR, and MD simulations
本研究通过整合冷冻电镜、核磁共振和分子动力学模拟技术,揭示了蝎毒 Charybdotoxin 与 MthK 钾通道的结合模式,阐明了其通过锚定赖氨酸插入选择性过滤器并维持高亲和力与广谱结合能力的分子机制。
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分子生物学探索着生命的核心密码,揭示基因如何运作、蛋白质怎样构建以及细胞如何交流。这一领域不再只是实验室里的深奥理论,而是理解疾病、开发新药甚至解读自身健康的关键。在 Gist.Science,我们致力于打破学术壁垒,让这些前沿发现触手可及。
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本研究通过整合冷冻电镜、核磁共振和分子动力学模拟技术,揭示了蝎毒 Charybdotoxin 与 MthK 钾通道的结合模式,阐明了其通过锚定赖氨酸插入选择性过滤器并维持高亲和力与广谱结合能力的分子机制。
该研究提出了一种名为 PICO 的无参考单囊泡定量检测技术,利用 DNA 条形码抗体与数字 PCR 结合,仅需微量样本即可在无需专用仪器的情况下,高特异性地解析液体活检中小细胞外囊泡的异质性并实现精准亚群定量。
该研究揭示了 RNA G-四链体(rG4)通过被 HNRNPH 蛋白解开以暴露多个结合位点,从而介导 HNRNPH 对 RNA 的间接协同结合,进而实现开关式的剪接调控,且这种机制在乳腺癌中因 rG4 破坏性变异和 HNRNPH 表达改变而显著影响肿瘤亚型特征。
本研究通过基于结构的药物设计开发了高亲和力 GID4 配体,揭示了其配体诱导的构象可塑性,并以此构建了 PROTAC 分子,尽管体外三元复合物形成成功但 BRD4 降解尚未实现,该发现为优化 GID4 介导的靶向蛋白降解提供了新的结构基础。
该研究通过 AlphaFold 建模、生化重构及功能实验,揭示了 PAF 复合物亚基 Prf1 的 HMD 结构域通过其 RING 结合区(RBR)重新定位 HULC 复合物中的 RING 结构域,从而将 Rad6-Bre1 E3 连接酶复合物“启动”至催化活性构象,进而促进组蛋白 H2B 泛素化的分子机制。
该研究揭示了一种由 RNA 引导的转录新机制,其中核酸酶失活的 Cas12f 蛋白与 σE 因子形成复合物,能够不依赖传统启动子序列而直接招募 RNA 聚合酶,从而实现可编程的基因激活。
该研究揭示了烟粉虱和褐飞虱等植食性昆虫独立进化出各自的唾液效应蛋白(BtRDP 和 NlSP104),通过靶向并促进植物 LRR-RLP 受体(如 NtRLP4/OsRLP4)的泛素化降解,从而协同抑制植物免疫反应。
该研究利用新型力控果蝇重复性脑损伤模型,揭示了重复性脑外伤导致性别特异性的运动与认知缺陷、神经退行性病变及线粒体相关蛋白组的破坏,为理解脑外伤的长期病理机制提供了重要工具。
本研究开发并表征了三种 Cre 依赖的 CRISPR 小鼠品系,实现了体内特定位点 DNA 甲基化的精准编辑,从而证实了 DNA 甲基化对基因表达的因果效应具有位点依赖性,为解析疾病相关 CpG 位点的因果关系提供了关键工具。
该研究鉴定出一种由环状 Smad1(circSmad1)编码的新型 194 氨基酸多肽 circSmad1-194aa,其通过竞争性结合 Id1 启动子上的 BMP 响应元件来抑制 ID1 表达并上调 MYOD1,从而促进骨骼肌细胞的分化与成熟。